电动自行车运用的电池种类有锂离子电池、聚合物锂离子电池、镍氢电池、镍镉电池、锌空电池、燃料动力电池等。
1、锂离子电池：锂离子电池的比容要好于镍氢电池，有关相同容量的铅酸蓄电池来说，锂离子电池的分量相当于一台笔记本电脑，这样老弱妇孺就都能够运用了。其寿数也能够比镍氢电池做得好。
当前的手机电池基本上都是选用这种电池。锂离子电池的内阻相比照较大，在电动自行车上运用会呈现电池行将彻底放电的时分感受车的动力缺乏。锂离子电池更首要的疑问是在过充电和过放电状况电池会发生爆破，手机电池都是运用的单体电池，再通过杰出的维护电路来合作使用，基本上杜绝了电池爆破的疑问。
而在电动自行车上运用，有必要要运用串连电池组，而串连电池组的维护电路的杂乱程度远远超越单体电池的维护电路，其资料成本也大大添加。当前一个杰出的锂离子电池维护电路的本钱挨近电池自身的报价。
2、聚合物锂离子电池：聚合物锂离子电池的爆破杀伤力低于锂离子电池。可是，也存在着爆破和焚烧的可能性。这也是与锂离子电池相同需求解决疑问的。
3、铅酸蓄电池：铅酸蓄电池为数量最多。铅酸蓄电池的报价最低，也最常用，我国是全世界铅酸蓄电池最大的出产国。其含污染的成分比较少，可收回性好。缺陷是比容小。也就是说，在相同的容量下，电池分量和体积都大。当前的铅酸蓄电池基本上是由浮充类型的电池展开而来的。浮充电池不适应疾速充电和大电流放电，尽管技术人员的花费了许多的汗水进行了行之有效的改善，能够进入实用了，可是其寿数仍是十分不抱负的。
4、镍氢电池：镍氢电池的比容比铅酸蓄电池好许多，单体电池的寿数也比较好，其大电流充放电特性也比铅酸蓄电池好。可是镍氢电池串连电池组的办理疑问比较多，一旦发生过充电今后，就会构成单体电池隔板熔化的疑问，致使整组电池敏捷失效。所以，国产的镍氢电池的要害技术疑问仍是充电器和电池管理体系的疑问，而这个疑问还没有导致各个电池制造商和车厂满足的重视。所以，镍氢电池的展开收到很大的制约。
5、锌空电池：锌空电池以其比容大、污染小而着称于世。电池选用换电的办法，更新电池锌板。替换一次锌板能够运用160公里到220公里。上海已经在全国率先垂范的展开了锌空电池在电动自行车方面的运用，在全市设立了数十个换电网点，创始了锌空电池在电动自行车方面运用的先河。可是，暂时还无法在上海以外的当地展开运用实验，一起其运用本钱也是铅酸蓄电池的数倍。若是，再进一步扩展其运用规模，有进一步下降运用本钱的可能性。
6、镍镉电池：镍镉电池的大电流特性比镍氢电池好，其抗过充电特性也比镍氢电池好，我国又是世界上镍镉电池的出产大国。一些人提出镉污染的疑问，我国如今还在许多的向欧洲出口镍镉电池及其运用商品，欧洲到2006年才开端约束。据中央电视台播映的音讯，神州五号仍是选用镍镉电池的。
