除催化剂、电解质膜和膜电极外，DMFC的性能还受温度、甲醇浓度和氧气压力、流密等因素的影响。
DMFC的可逆电动势甲醇浓度的增大而提高，但由于甲醇的膜渗透损失，开路电压和工作电压严重偏离理论可逆电势。
甲醇浓度低时，由于传质和浓差极化，在较高电流密度时，工作电压急剧降低，DMFC不能获得高性能。甲醇的渗透损失随甲醇浓度的增大而加剧，当甲醇浓度大于0.6moVL时，工作电压不增反降。另有研究显示，在65一901C、空气压力0.05一0. 25MPa范围内，甲醇溶液浓度分别为I moVL和2moVL时，DMFC的性能并无明显差别。为降低甲醇渗透的影响，提高甲醇利用率.DMFC不能使用高浓度甲醇，甲醇溶液浓度一般为0.5 - 1.5moVL(质量分数1.6%一4.8%)。
温度升高和氧气分压增大，都使DMFC的性能提高。提高电池的工作温度可以提高阳极的催化活性，使H2O能在更低的电位下克服反应式(8-9)的活化能，生成了RuOH0同时也提高了RuOH与甲醇氧化中间产物的反应速率，减小了阳极的活化过电位，电池性能大幅度提高。
