锂离子电池在正常使用过程中对人体和环境都是没有危害的，但是报废的锂离子电池假如处理不当的话，会对环境造成危害，然后通过环境用途到周边的生物及人体。这重要是因为锂离子电池中含有的六氟磷酸锂、聚丙二乙烯(醇)等化学物质会对环境造成有机污染。另外其含有的钴等重金属元素，也会对环境会造成危害。
如在对废锂离子电池的处理上，首先要对其进行预处理，包括放电、拆解、粉碎、分选；拆解之后的塑料以及铁外壳可以回收；然后再对电极材料进行碱浸出、酸浸出，多种程序之后然后再进行萃取。
废旧锂离子电池的电解质及其转化产物，如LiPF6，LiAsF6，LiCF3S03，HF，P201等，溶剂及其分解和水解产物，如DME，甲醇、甲酸等，都是有毒有害物质，还是要将废旧锂离子电池送到有资质的地方进行统一处理，不要随意丢弃。
锂离子电池中包含多种有毒害性物质，具有很强的腐蚀性和污染性。另外，废锂离子电池电解液含有毒性极强、易燃易爆、腐蚀性强的电解质和有机溶剂。假如随意丢弃或外泄，将对大气、水、土壤造成污染和破坏。而且电解液泄露及温度过高等会造成电池爆炸和火灾等危险，直接威胁人们的生命和财产。
除此之外，废锂离子电池在破碎分选、高温热解预处理过程中会出现一系列的污染物，如电解液的分解、塑料薄膜热解、破碎粉尘、废渣等，这些污染物不仅对大气、水体造成严重污染而且对设备有严重的腐蚀性，同时工艺过程中要添加的各种酸碱浸提剂、萃取剂、活性添加剂等不仅新增回收工艺流程的成本，造成资源浪费和能耗新增，而且大量的废水、废气、废渣、废添加剂等新增了二次污染。
