UPS蓄电池的保护与一般低压体系蓄电池的保护相似，当引入新电池时，要求工程验收，进行深度放电;当新UPS电池投入运用后，要求保持适宜的电池作业环境温度，要求按时丈量各电池端电压，当各电池压差过大时，要进行均充，要求按时对电池进行试探性容量实验或深度放电，以便查看电池组的性能好坏以及保持电池的活性。
可是实践运用中，因为各种条件的限制，UPS蓄电池的保护很少有人完全依照上面所述进行，首要新电池验收，因为时间长，又无便利东西可供运用，有适当多的人底子没有做这一作业行将电池投入运用，据统计，在我国大陆约有95%以上的UPS电池缺乏必要的保护，这为日后UPS供电毛病埋下隐患;其次，新电池投入运用后，因为一般UPS电池是装在柜子里，丈量、脱离都不便利，很少丈量端电压，按时深度放电更是无从进行。
依现有条件，广大保护人员所能进行的只有每隔一段时间，封闭市电让UPS电池对实践体系放电一段时间，充其量只是让电池组活化一下，以保持电池的活性，而关于电池的性能好坏及各节电池的剩下容量等重要数据仍是无从知晓。
